Злой разбойник Бармалей, именем которого давно пугают детей, сидит в тюрьме, под охранной гиппопотама. Однако пиратам удается освободить его, после чего они отправляются на своем корабле в Африку. На этом же судне оказывается и сестра доктора Айболита, ненавидящая животных, которых лечит ее добрый брат. Приплыв к берегам Африки, разбойники приготавливают для зверей отравленные угощения, съев которые они тяжело заболевают. Гиппопотам, которому удалось проникнуть на судно пиратов, звонит доктору Айболиту и просит его помочь бедным животным. Добрый доктор, вместе с верными друзьями, тут же отправляется в Африку. Впереди их ждет опасное приключение, полное самых неожиданных испытаний, справиться с которыми им поможет только настоящая дружба...